У Чехії розвинений великий державний сектор вищої освіти, де вартість навчання залежить від мови викладання. За даними офіційного порталу Study in Czechia, програми чеською мовою в державних університетах безкоштовні незалежно від громадянства, але зазвичай потребують підтвердження знання чеської (часто не нижче B2), а вступники все одно сплачують реєстраційний збір. На програмах англійською мовою вартість навчання встановлює кожен університет або факультет: за даними порталу, більшість коштує 0-6 000 EUR на рік, а медицина, мистецтво та деякі спеціалізовані напрями - 8 000-25 000 EUR. Приватні університети самі визначають розмір плати; один із приватних університетів Праги вказує на 2026/27 рік приблизно 299 000-311 000 CZK на рік для іноземних студентів бакалаврату.
Студенти з країн поза ЄС, які перебувають понад 90 днів, отримують довгострокову візу (максимум на один рік) або довгостроковий вид на проживання з метою навчання. Заяви подаються до посольства чи консульства Чехії, законний строк розгляду становить 60 днів, консульський збір за даними Міністерства закордонних справ - 2 500 CZK. Мета навчання обмежена акредитованими університетськими програмами та деякими іншими переліченими видами навчання. Потрібно підтвердити наявність житла, коштів (формула Міністерства внутрішніх справ: 15-кратний прожитковий мінімум за перший місяць плюс подвійна сума за кожен наступний місяць) та повного медичного страхування; рекомендації на сторінках університетів називають мінімальний ліміт страхування 400 000 EUR. На практиці має значення громадянство: для громадян Росії та Білорусі діє урядове обмеження візових послуг з вузькими винятками, тоді як Туреччина, Казахстан, Азербайджан та Україна значаться у списку країн програми Student Facilitation (Režim Student) станом на 1 січня 2024 року.
Згідно з офіційним порталом, студентам денної форми навчання з країн поза ЄС в акредитованих чеських університетах окремий дозвіл на роботу не потрібен, однак метою перебування залишається навчання, а роботодавці зобов'язані повідомляти про працевлаштування. Орієнтир офіційного бюджету студента - близько 500-800 EUR на місяць, кімнати в гуртожитках - 160-450 EUR на місяць залежно від типу кімнати. Після завершення навчання студенти з країн поза ЄС можуть подати заяву на вид на проживання строком до 9 місяців для пошуку роботи або підготовки до відкриття бізнесу. Попередню іноземну освіту, як правило, потрібно визнати (нострифікація) або підтвердити в межах вступу до університету; державні університети беруть 3 000 CZK, законний строк ухвалення рішення - 30 днів.
Урядова стипендія Чехії для країн, що розвиваються, покриває навчання та щомісячну стипендію (16 000 і 24 960 CZK на місяць) на окремих англомовних програмах магістратури (продовження навчання) і докторантури, однак до списку країн на 2027/28 рік (13 країн і демократичні сили Білорусі) не входять Туреччина, Росія, Казахстан та Азербайджан, а прийом заяв завершився 30 вересня 2026 року. Більшість університетів починають навчання у вересні; деякі факультети Масарикового університету також приймають студентів у лютому. Терміни, збори та пороги з англійської мови різняться за факультетами й змінюються щороку, а кілька перевірених сторінок усе ще показували цикл 2026/27, тому перед поданням заяви дані щодо програми слід уточнити на сторінці університету.